Le navigateur de génome de prochaine génération qui fait avancer les travaux

ESSAI GRATUIT

Pistes du navigateur du génome

Génome

Multiples versions du génome: hg38, hg19 and mm10

Gènes

50000 gènes et 111000 transcripts de RefSeq.
Affichage des nomenclatures HGVS.

Variants publiques

Plus de 700 000 000 de variants de dbSNP, gnomAD, Clinvar, GoNL, HGVD, 1000Genomes et ESP.

Épissage

Prédiction d'épissage sur les transcripts avec MaxEntScan, SSF et NNSplice

Régulation d\épissage

Régulation d'épissage sur les transcripts

Conservation nucléotidiques

Affichage des données Phylop de l'UCSC

Orthologues

Alignements orthologues sur plusieurs espèces pour le transcript

Variants privées

Les variants peuvent être enregistrées dans un espace privé et disponibles sur cette piste

Annotations privées

Les annotations peuvent être enregistrées dans un espace privé et disponibles sur cette piste

Repeat masker

Afficher les séquences d'ADN pour les répétitions intercalées et les séquences d'ADN de faible complexité

CNV

Afficher les variants structuraux DGV et de gnomAD

Structures secondaires

Structures secondaires d'uniprot et prédites par spider3 sur tous les transcripts

Lire la documentation

Annotation de variants

Archigene Browser intègre la création de variantes et l'annotation de manière simple et intuitive.

Annotation sur toutes les transcripts d'un gène
Nomenclatures HGVS
Impact sur les transcipts et les protéines
Impact sur l'épissage avec les prédicteurs
Correspondance avec les variants publiques
Classification privée, commentaire et phénotype

Commencez à naviguer dès aujourd'hui !

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